В целом - нунчаку обучают там же, где обучают каратэ.
Могу сообщить, что "кобудо", то бишь древние окинавские стили работы с оружием практикуют в федерациях Кёкусинкай каратэ, а также Федерации Сито-рю каратэ-до (см. раздел Школы и секции на сайте).
Специализированных школ именно по нунчаку у нас, насколько я знаю, нет. Хотя в целом вРоссии представлено такое направление - Нунчаку-до, по которому даже проводятся соревнования.
В наших школах каратэ - проще. Поскольку ученики базу каратистскую изучают по определению, чуть позже на эту базу накладывают классические формы работы с оружием - бо, тонфа, сай, нунчаку. Именно что фехтованием обычно не занимаются, работают больше ката (комплексы) и обусловленные парные формы.
Ну, на показательных выступлениях еще могут "покрутить". Лично я еще в детстве самостоятельно сей предмет осваивал. По книжкам, по фильмам и все такое прочее. Естественно, большим спецом не стал, но покрутить или бутылку/арбуз расколотить умею.
Ежели есть желание самостоятельно попрактиковаться - поищите пособия Комлева (книги и видео), неплохой материал, как мне кажется.